MMT

Az "All-Species Living Tree Project" új kiadása

A 2007-ben indult “The All-Species Living Tree» projekt a spanyol IMEDEA (Mediterranean Institute for Advanced Studies), az MPI (Max Planck Institute for Marine Microbiology), valamint a TUM (Technical University at Munich) ARB közös kezdeményezése, amely mögé állt az ELSEVIER Systematic and Applied Microbiology folyóirata is. Céljuk, hogy Bacteria és Archaea típustörzsek teljes mértékben ellenőrzött 16S rRNS gén bázissorrend adatbázisára alapozva építsék föl a legmegbízhatóbb baktérium filogenetikát. A rendszeresen frissített baktérium leszármazási rendszer igen hasznos a taxonómusoknak. A legújabb kiadásban (LTP_2020; Ludwig et al., 2021) lényeges változásokat tapasztalhatunk. Nagyon sok új gén bázissorrendet illeszettek be, ill. több, mint kétszeresére nőtt a számításba vett homológ pozíciók mennyisége. Ennek következtében a taxonok helyzete a törzsfában sokkal pontosabb, megbízhatóbb lett. A szerzők várják és megköszönöik a felhasználók jelzéseit az esetleges hibák javítására, vagy pedig a taxonómiai hiányok pótlását illetően. Az érdeklődők jelenkezhetnek a “The All-Species Living Tree» projekt honlapon, hogy elektronikus értesítést kapjanak az újdonságokról, vagy kapcsolatba léphetnek a projekt munkatársaival.

Keresés